CQCとは「Close Quarters Combat」の略ですね。
銃器や格闘などを使用した近接格闘の事です。
基本的には至近距離での短時間戦闘を指します。

「ミヤコちゃんも使えるの？」

はい。
SRT特殊学園では基本でしたから。
ヴァルキューレの生徒も使える筈ですよ。